Las bacterias del grupo de Pseudomonas fluorescens y las del género Bacillus son consideradas las más eficaces para controlar enfermedades foliares y de las raíces.Estos mostraron la capacidad de inhibir el crecimiento de hongos fitopatógenos del suelo, como Fusarium oxysporium, f. s. lycopersici, Pythium ultimun, R. solani, S. rolfsii, Phytophtora nicotianae, Fusarium moniliforme y Fusariun solani.
