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ADN (Réparation (Mutations (Types (Silencieuse (ADN non essentiel, Même aa…

- - - - Permanent
      - Séquence
        
        Nucélotide
      - Substitution
        
        Addition
        
        Délétion
    - - Silencieuse
        
        ADN non essentiel
        
        Même aa
        
        Négligeable
      - Transition
        
        A <--> G
        
        T <--> C
      - Transversion
        
        Purique <--> pyrimidique
      - Faux sens
        
        Mauvais aa
      - Non sens
        
        Codon stop
      - Neutre
        
        Aa proche
        
        Pas gros bouleversement
      - Insertion
        
        Décalage
    - - Favorable
        
        Avantage
      - Néfaste
    - - Chimiques
        
        Transforment base
        
        Désamination
        
        Cytosine
        
        Perturbe réplication
        
        Intercalant
        
        Provoque transitions
      - Physiques
        
        Radiations
        
        X
        
        γ
        
        UV
        
        --> coupure
        
        Simple brin
        
        Double brin
        
        Pontage ADN-protéine
      - Détection
        
        test AMES
        
        Salmonella
        
        Auxotrophe His
        
        --> pousse sur milieu minimum
        
        Pousse si mutagène
    - - Désamination oxydative
        
        C --> U
        
        G --> xanthyme
        
        Même appariement
        
        A --> hypoxanthine
        
        Apparie C
        
        Acide nitreux
        
        HNO2
      - Dépurination
        
        Perte base
        
        Chaleur
        
        Enzyme
        
        mutagène
      - Dimère thymine
        
        UV
        
        Liaison covalente
        
        Bloque réplication
        
        Déformation
      - Alkylation
        
        Déformation hélice
        
        Ajout groupement alkyle
        
        Méthyl
        
        Mauvais appariement
        
        Hydroxylamine
        
        NH2OH
        
        Méthylméthane sulfonate
      - Agents intercalants
        
        Proflavine
        
        Acridine orange
        
        Structure
        
        Géométrie
        
        Comparable
        
        2 bases
        
        Ajout au hasard
        
        --> Décalage
      - Analogues de bases
        
        Analogies structures
  - - - Inactivation
        
        Activité
        
        correction
        
        ADNpol
        
        Mécanismes
        
        Réparation
        
        Mésaparriements
      - Modification
        
        Balance pool
        
        Déséquilibre
        
        Concentration
        
        Nucléotides
        
        Bases azotées
      - Mutation
        
        Site actif
        
        ADNpol
      - Contexte séquence
        
        Séquences répétées
      - Fréquence erreur
        
        Appariement des bases
        
        10-1 à 10-2
        
        ADNpol
        
        Sélectivité
        
        Correction
        
        exonucléase 3'-5'
        
        10-5 à 10-6
        
        Protéines accessoires
        
        10-7
        
        Corrections
        
        post-réplicatives
        
        10-10
  - - - E. coli
    - - S'arrête sur mésappariement
        
        Erreur ADNpol
        
        Tautomérisation spontanée
        
        Post-réplicative
        
        Imperfections
        
        Correction épreuves
        
        Distorsion hélice
        
        --> Enlève mauvais nucléotide
        
        --> ADN ligase
        
        Remplacement
        
        Distinction brins
        
        Différence méthylation
        
        Méthylation lente
  - - - Rupture dimère thymine
      - ADN photolyase
        
        2 coenzymes
        
        Activité à la lumière
    - - Pas enzyme
        
        Car capte groupement
        
        Pas intact
  - - - Base Excision Repair
      - 1
        
        Reconnaissance
        
        Base endomagée
      - Petite ampleur
      - 2
        
        Clivage
        
        Proximité site AP
        
        Sucre sans base
        
        Endonucléase
      - 3
        
        Phosphodiestérase
        
        Élimine 1 (P)
      - 4
        
        ADNpolI
        
        Dégradation
        
        Synthèse
        
        Ligase
        
        Comble brèche
      - Uracylglycosylase
    - - Nucleotide Excision Repair
      - E. coli
        
        Uvr ABC
        
        Voir schéma
      - Grande ampleur
  - - - Substances
        
        Toxiques
        
        Mutagènes
  - - - Échange de brin
        
        Voir schéma
  - - - --> Bloque ADNpol III
        
        Substitution
        
        Par IV ou V
        
        Moins fidèle
        
        N'importe quelle base en face lésion
- - - - Cellule mère
      - Réplication
      - Formation septum
      - Division binaire
      - Séparation
    - - cellule mère
        
        Quiescence
        
        G0
        
        Majorité du temps
      - G1
        
        Aggrandissement
      - S
        
        Réplication
        
        Duplication chromosomes
      - G2
      - Mitose
  - - - Double hélice
    - - 2 fourches
        
        Jonction
        
        Se déplace
  - - - Théta
        
        2 brins en même temps
        
        Séparation
        
        Point d'origine
      - En cercle tournant
        
        Réplication d'un brin en libérant l'autre
        
        Réplication du deuxième brin
        
        Certains virus
        
        Eléments accessoires bactéries
    - - Origines réplication multiple
      - Problème
        
        5' vers 3'
        
        Problème aux extrémités
  - - - ADN
      - Réplicaiton
        
        Individuelle
    - - Fréquence
        
        Réplication
    - - Cycle réplication
    - - Chromosomes
    - - Petits
        
        Plusieurs origines
      - Lents
    - - Unique
        
        1 seule origine
      - Rapide
  - - - Maraquage
        
        Radioactif
        
        3H-thymidine
      - MET
        
        Distance
        
        Extrémités
  - - - Conservatif
        
        1 mère, 1 fille
      - Dispersif
        
        Mélangé
      - Meselson et Stahl
        
        1958
        
        Marquage radioactfi
        
        Plus lourd
        
        Centrifugation
        
        Mère
        
        Fille
  - - - E. Coli
        
        Initiation
        
        Séparation
        
        brins parentaux
        
        Stabilisation
        
        transitoire
        
        1 seul brin
        
        Syntèse
        
        Fourche
        
        Complexe protéique
        
        primosome
        
        Structure
        
        2 more items...
        
        Amorces ARN
        
        2 more items...
        
        Reconnaissance
        
        Complexe protéique
        
        Originie
        
        oriC
        
        Riche en AT
        
        DNAA boxes
        
        2 more items...
        
        Elongation
        
        Complexe protéique
        
        réplisome
        
        Déplacement
        
        Déroulement
        
        1 more item...
        
        Synthèse
        
        1 more item...
        
        ADN polymérase
        
        I
        
        Amorces
        
        Elimine
        
        Remplace
        
        3 Domaines
        
        Fragment de Klenow
        
        3 more items...
        
        Extrémité NH3+
        
        1 more item...
        
        Peu erreur
        
        Correction
        
        2 more items...
        
        II
        
        Réparation
        
        III
        
        Elongation
        
        Réplicase
        
        10 sous-unités
        
        Coeur catalytique
        
        "main"
        
        Entoure ADN
        
        IV
        
        Réparation
        
        V
        
        Réparation
        
        Substrat
        
        dNTP
        
        5'-P
        
        3'-OH
        
        Amorce
        
        Appariée
        
        1 more item...
        
        Brin retardé
        
        Amorce périodique
        
        Fragment Okazaki
        
        Mise en évidence
        
        1 more item...
        
        Forme boucle
        
        Permet avancement ADNPolIII
        
        ADNPolI
        
        Remplace
        
        Amorces
        
        2 more items...
        
        Surenroulement
        
        Par séparation des brins
        
        Empêche déroulement
        
        Réduite
        
        Par topoisomérase
        
        Hélicase
        
        Sépare les brins
        
        Présence
        
        ATP
        
        Protéine
        
        1 more item...
        
        = DNAB
        
        gène dnab
        
        Voir diapo
        
        Terminaison
        
        Extrémité
        
        Replicon
        
        Enzymatique
- - - - Nucléotide
        
        Nucléoside
        
        Sucre
        
        Pentoses
        
        OH sur 2
        
        ADN
        
        1 more item...
        
        ARN
        
        1 more item...
        
        Bases azotées
        
        purines
        
        Adénine
        
        6-aminopurine
        
        Guanine
        
        2-amino-6-oxopurine
        
        Liaison β-N9
        
        -osine
        
        Pyrimidine
        
        Thymine
        
        5-methyluracile
        
        5-methyl-2,4-dioxopyrimidine
        
        Cytosine
        
        4-amino-2-pyrimidine
        
        Uracile
        
        ARN
        
        2,4-dioxopyrimidine
        
        Liaison β-N1
        
        -idine
        
        Conformation
        
        anti
        
        pas le même côté
        
        plus stable
        
        purine
        
        encombrement stérique
        
        syn
        
        même côté
        
        Phosphate
        
        Acide
        
        Forme déprotonnée
        
        sels
        
        liaison ester
        
        Alcool + Acide = Ester + H2O
      - Liaison phosphoester
        
        Pont phosphodiester
      - Polarité
        
        5' phosphate
        
        3' OH
  - - - Droite
    - - antiparallèles
    - - extérieur
    - - Perpendiculaire
      - intérieur
      - Paires
        
        purine-pyrimidine
        
        liaison H
        
        A-T
        
        2 liaisons
        
        G-C
        
        3 liaisons
    - - Incrément
        
        0,33nm/nucléotide
        
        Entre les bases
      - Tour
        
        Pas
        
        3,4 nm
        
        34 A
        
        10,4 nucléotides
      - Diamètre
        
        2,0nm
        
        20 A
    - - Bases
        
        Plan
        
        Liaison H
      - Empilement
        
        Stacking
    - - Grand
      - Petit
  - - - Droite
      - Tour
        
        11 paires
      - Pas
        
        28 A
      - Diamètre
        
        23 A
  - - - Gauche
    - - Pohl, Jovin
        
        1972
      - Rich
        
        1979
  - - - Amino
        
        NH2
        
        Majoritaire
      - Imino
        
        Minoritaire
        
        NH
    - - céto
        
        =O
        
        majoritaire
      - énol
        
        N=OH
        
        minoritaire
    - - (C)-A
      - (T)-G
      - C-(A)
      - T-(G)
      - rares
      - perte fidélité
        
        mutation
        
        réparation
- - - - extraction ADN
        
        riche en acide phosphorique
  - - - 4 bases azotées
        
        purines
        
        pyrimidines
      - sucre
        
        pentose
  - - - polymère
        
        nucléotides
        
        base
        
        Sucre
        
        phosphate
        
        liaisons phospho-ester
      - téranucléotide
  - - - 1944
        
        Avery, MacLeod, McCarty
        
        ADN proteur information génétique
      - 1952
        
        Hershey
        
        Chase
        
        femme
        
        Marquage radioactif
        
        Confirmation matériel génétique
      - 1949
        
        Chargaff
        
        Composition ADN
        
        Autant purine que pyrimidine
        
        Règles de Chargaff
        
        A + G = T + C
        
        A/T = G/C = 1
        
        A+T/G +C constant
      - 1952
        
        Franklin
        
        Femme
        
        Gosling
        
        étudiant
        
        Photographie
        
        Diffraction ranyons X
        
        Cliché 51
        
        Structure hélicoïdale
      - 1953
        
        Pauling
        
        Triple hélice
        
        faux
      - 1953
        
        Watson
        
        Crick
        
        double hélice
        
        anti parallèle
        
        appariement
        
        réplication
- - - - UV
    - - ADN double brin long
        
        1 A260 = 50 um/ml
    - - ADN double brin long
        
        A260/A280 ~ 1,8
  - - - Température élevée
        
        Effet hyperchrome
        
        Montée soudaine
        
        Dû au désempilement
        
        Tm
        
        Température de fusion
        
        50% ADN dénaturé
        
        Influencé
        
        Proportion G-C
        
        %GC
        
        coefficient de Chargaff
        
        plus résistant
        
        longueur
        
        nombre pb
        
        Environnement
        
        pH
        
        salinité
      - Faible concentration en sels
      - pH élevé
        
        solutions alcalines
      - petites molécules organiques
        
        urée
        
        DMSO
        
        Formanide
        
        guanidine
  - - - Diminution température
      - Forte concentration ADN
- - - - Sauf VIrus à ARN
  - - - 3,2 milliards pb
    - - 1-13millions pb
  - - - Procaryote
        
        1
        
        circulaire
        
        Linéaire
      - Eucaryote
        
        Humain
        
        23
        
        linéaire
    - - Associé protéines