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Peptide (Liaison peptidique (F. peptide anti-Microbiens (caractéristiques,…
Peptide
Liaison peptidique
A.Laison amide
Liaison covalente stable
Réaction de condensation
mésomérie
rigidification de la molécule
B.Chaine polypeptidique
polarisé
Structure primaire = enchainement linéaire
numéroté de gauche a droite depuis N-term
C.Nomenclature
AA pris = residus
-yl
sauf pour le dernier
-20 résidus = oligopeptide
20 à 50 : polypeptide
+50 = proteine
parenthèse = variant génétique
D.Charge
Identifier les groupement ionisable
trouver les pKa
placer dans l'ordre croissant
E.Liaison isopeptide
amine ou carboxillique chaine latérale
mécanisme post-trad
Ubiquitinylation exemple
Blessure et saignement
thrombine
coupe fibrogène
active facteur XIII en XIIIa
laison covalente iso entre fibrine
rend insoluble
Coagulation et stérilité
F. peptide anti-Microbiens
Dans les epithéliums pas dans le sang
action locale
caractéristiques
immunité innée
formé de 12 a 50 AA
Amphiphile
Chargé
structure tertiaire diverse et spécifique
Cationique
peptide linéaire forme helice alpha
% élevé d'un seul AA
riches en C présentant un ou plusieurs ponts disulfures
non cationique
anioniques
dérivés des proteines liants l'oxygène
Mode action
insertion dans la bicouche lipidique des membranes des bactéries
lyse agent pathogène
liaisons à des facteurs viraux
modulation de la réponse inflammatoire secondaire
H.mise en évidence de la liaison peptidique
absorption dans UV
Chromophore proteiques
Liaison peptidique 215-230
D,E,N,Q,R et H
chaine AA 280 nm
Réaction du Biuret
Qui coupe quoi
Thrombine apres arg mais surout entre arg et Gly