Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Gene expression hos bakterien (kontroll av gene expression (recombination…
Gene expression hos bakterien
varför reglerar bakterien genuttrycket?
snabb adaption till omgivningen
stoppa syntes av unnecessary genes and products
spara energi
högre evolutionär överlevnad
Bakterier är
hapoloida
polycistronic operon (oftast)
kräver ingen spliceing
därav är bakterien mycket mer effektiv när det kommer till centrala dogma
finns någonting som kallas "monocistronic operon"
kontroll av gene expression
gene amplification
recombination
skapar fler och fler kopior av genen
antigenic variation
silent and active gene kombineras (ändrar sin antigen) för att ex lura immunsystemet från att förstöra bakterien
transposition
många kopior av transposoner i koromosomen
förändring av DNA sekvensen
A.phase variation ("on-off expression")
slå på och av genuttryck baserat på om den behöver genen eller inte
Promotorns placering, avgör om DNA sekvensen blir aktiv eller inte
mängd av mRNA
påverkas av hur bra RNA polymerase binder in till genuttryckets promotoromrpde och dels av hur transkriptionsfaktorerna i operator området ser ut: aktivatorer eller repressorer (signalerar för hur mkt en gen skall transkripteras)
translation effektivitet
The central dogma
transkriptionell reglering
Sigma factor
- en faktor som sitter på RNA-polymeraset (finns flertal olika - beroende på vilken gen man vill syntesisera), som känner av en specifik plats på mRNA så att RNA-polymeraset kan binda in så att transkriptionen kan sättas igång
Olika sigma faktorer aktiveras av olika stimuli (värmeskillnad, tryck?). På så sätt kan bakteriens transkription regleras beroende på vad som är väsentligt just nu beroende på miljön bakterien befinner sig i. Det kan hända att det är fler sigma faktorer aktiveras, så att ett flertal gener som gynnas i ex värmehöjande temperatur blir transkriptionerade.
pathogenicity Islands
virulence gener
är reglerade oftast av prfA
transkriptions regulatorer
repressorer och dess co-repressor (hjälper till)
De är aktiva då onödiga gener (som ej behövs eller gynnar bakterien just nu), därav blir detta genuttryck minimeras och vidare kommer det inte transkriperas
järn är en co-repressor
aktivatorer och dess co-aktivator (hjälper till)
högt genuttryck
Dessa avgör hur svag eller stark ett RNA-polymeras binder till till mRNA