Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

Модели кальциевой активности в астроцитах (Mechanism-based (Новые…

- - - - Точечная модель
        
        способность к frequency modulation and amplitude modulation,
        влияние аллостерической регуляции NCX натрием и кальцием.
        Note: See DePitta,...,Ben-Jacob (2008) PhysRevE
        
        Какие еще (интересные) режимы работы возможны?
      - распределенная модель
        
        Как NCX влияет на распространение кальциевых транзиентов?
        
        Как NCX влияет на частоту инициации и регулярность кальциевых транзиентов?
    - - TRPA
      - TRPC
      - TRPV
  - - - 3D
      - Ввести понятие SVR: surface to volume ratio — будет определять (как continuous variable, а не бинарно, как раньше) вклад ER и PM-механизмов
      - ввести понятие AVF: astrocyte volume fraction
        Сома и основные ветки (внутри) содержат только астроцит. Область тонких отростков содержит весь локальный нейропиль, соответственно доля объема пикселя, приходящаяся на астроцит меньше единицы
        
        Влияет на описание диффузии: если AVF =1 DCa выше, чем когда AVF << 1
        
        Влияет на описание диффузионного обмена:
        небольшое изменение концентрации в области AVF может вызвать большее изменение концентрации в области с низким AVF
      - [low priority] Анизотропная диффузия: возможно, DCa может быть быстрее по направлению к соме, чем от нее.
    - - использовать тот же алгоритм, что и для поодготовки к Sholl
  - - - Если сделать шаблон из идентичных клеток, будет или не будет возникать устойчивая последовательность с ведущим центром?
        
        Как на это влияют свойства gap-junctions?
        Сейчас в модели мы их разбрасываем случайно вдоль границ клетки с определенной вероятностью
        
        Если не возникает, какое элементарное изменение морфологии можно добавить в один из элементов, чтобы он стал ведущим центром и появился устойчивый паттерн?
        
        Если все-таки возникает, то где и почему?
      - Если сделать гетерогенный шаблон, но варьировать плотность gap-junctions?
      - Если сделать несколько гетерогенных шаблонов из одинаковых клеток, которые отличаются только распределением gap-junctions (с одной вероятностью, но разный random seed) — будет ли всегда одна и та же клетка становиться ведущим центром?
- - - - Поиск устойчивых пространственно-временных мод