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真菌在地球上泛存於空氣、水、土壤以及各類生物的體表或體內。
真核生物中的一大類群，包含酵母、黴菌之類的微生物以及為人熟知的菇類。
可小如肉眼看不到僅數微米大小的酵母菌，到可有數公尺直徑的大型多孔菌
真菌具有以幾丁質為主要成分的細胞壁，與動物同為異營生物，依賴其他生物製造的有機物為碳源，通常以滲透營養的方式取得養分。
不能行光合作用，其成長型態與植物一樣不能移動，但可以透過菌絲的延長拓展棲地，也能透過經由有性或無性生殖產生的孢子進行長距離的傳播。
生態系中的主要分解者，且在生態系的物質循環扮演重要角色。
寄生
黴菌
用於醫療：方面有盤尼西林，是由青黴菌所製造
用於食品：起司是發酵後再加入青黴菌所製成的。
醬油、豆瓣醬、豆豉和味噌等需要米麴菌發酵。
紅糟、豆腐乳和紅露酒等則是由紅麴菌所發酵製造。
發酵臭豆腐的臭滷水也含有多種菌種。
疾病方面
皮癬菌感染：如香港腳、頭癬及股癬
芽胞菌感染：像汗斑或皮屑芽胞菌性毛囊炎
念珠菌感染：念珠菌性尿布疹及念珠菌口腔炎 等等
冬蟲夏草
幼蟲沾染真菌而被寄生，真菌在蟲體內生長，慢慢造成宿主死亡，過了冬天到春季夏季長出繁殖用的子實體。
酵母菌
酵母菌是生長在含糖分的物質上，像是土壤、空氣中、植物體、動物體中生存外與讓食物發酵。
但容易對免疫力低下的病人造成感染。
酵母菌感染屬於真菌感染，像是在免疫系統缺陷者身上，可能導致感染病症。
互利共生
地衣
藻類和菌類的共生體：藻類行光合作用提供養份給菌類，菌類提供水份和無機質給藻類。
豆類植物
植物供給根瘤菌以礦物養料和能源，根瘤菌固定大氣中游離氮氣，為植物提供氮素養料
片利共生
蘭花
大多數無法自己發芽，只能靠蘭菌的侵入且共生，然後它吸收、消化蘭菌，用它的養料來成長。
但某些蘭花長出葉後可行光合作用製造有機養分，並提供部分有機物給真菌。
