A partir de las hipótesis que el grupo interdisciplinario ha escogido, se desarrolla el pan de investigación, en el cual se establece cuales son las preguntas a las que se les está buscando respuesta. Esto significa que en el conjunto de información se identifican los vacíos que existen en la manera en la que van a obtener los datos que la complementan. También se debe establecer qué actividades se adelantarán, quiénes la vana hacer y con qué recursos se cuenta. Algunas de las diligencias judiciales previstas en la ley son las inspecciones judiciales, allanamientos, interceptaciones, entrevistas, versión libre y espontánea, testimonios, peritaje, entre otros.