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Noyau et nucléole - Relation nucléo-cytoplasmiques (D. Synthèse et…
Noyau et nucléole - Relation nucléo-cytoplasmiques
I. De la structure de la chromatine à l'expression d'un gène
A. Passer du génotype au phénotype
traduction = production de proteine dans le cytoplasme
Transcription = production de l'ARN
il y a une variabilité dans l'efficacité de l'expression genique
B. Mécanismes généraux de la transcription
Appariement des base : support de la transcription
Elongation de la chaine ARN catalysée par une ARN polymérase
transcrit de 5'->3' et se deplace dans le 3'->5'
pas besoin d'une helicase
Brin à transcrire défini par le sens de progression de la polymérase
On sait quel brin est transcrit d'ou l'importance de son orientation
Brin transcrit et brin matrice
Brin transcrit = Ne joue pas de role
Brin matrice = celui qui est codé
Séquence à transcrire définie par des séquences particulières
Origines de la transcription
La séquence promotrice (site de fixation de ARN pol)
Terminaison de la transcription non déterminée a ce jour
C. 3 sortes de transcription chez les eucayotes
3 groupes de gènes par 3 sortes de polymérases
Un gène code pour une ARN et non une proteine
ARN pol I
ARN Ribosomique sauf le 5S
ARN pol II
ARN messager, micro ARN,siRNA, snRNA
ARN pol. III
ARNt ARN ribosomique 5S, snRNA
Nécéssité de facteur généraux de la transcription
TF
TF I = ARN pol.I
TF II = ARN pol. II
TF III = ARN pol. III
D. Synthèse et maturation des ARNm par ARN pol II
Anatomie du gène d'une proteine
Promoteur
gène domestiques nécéssaire a la maintenance de l'activité cellulaire
On retrouve un site de fixation de l'ARN pol et de certaines proteines régulatrices de la transcription (souvent boite TATA)
Partie transcrite
Un exon n'est pas forcément codant ( exon 3' UTR ou 5'UTR)
Le +1 de la transcription = ajout de la queue poly adénine (role important pour la préservation de l'ARN)
Amorçage de la transcription
Il faut une boite TATA
des gènes de ménage : nécessaire à des fonctions communes
facteur proteiques additionnels
Une association de facteurs généraux de la transcription
La séquence CTD
Indispensable a ARN pol II car TFIIH en contact phosphoryle le domaine C-term pour fixer la coiffe
Proteine d'activations, de répression de médiation et de modification de la chromatine -> agissent sur la capacité aux facteurs généraux de se fixer ou non et se fixent sur la boite TATA
TBP recrute d'autres facteurs dont TFIIH qui mène une activité helicase et kinase
3.Elongation et terminaison de la transcription
ARN pol II garde toujours son domaine C-term phosphorylé
Addition de la coiffe en 5' du pré-ARNm
Procaryote = ARN polycistroniques = un ARN peut produire différentes proteines
Eucaryote = monocistronique = privilige la qualité
La phosphorylation de la sérine 5 de la polymerase II participe au recrutement des enzymes qui vont catalyser la production de cette coiffe
La kinase recrute les enzymes qui vont jouer un role dans l'epissage
La dephosphorylation de la sérine pendant l'élongation ce qui permet au recrutement de facteurs de maturation de l'extremité 3'
Domaine C-term important pour ADN pol II car il recrute les facteur de la coiffe, les facteurs d'épissage et le facteur nécessaire à la polyadénylation
Addition d'une queue poly A
Le signal de coupure localisé apres le codon stop
poly-adenine pol. polymérise la queue A, pas besoin de matrice ou d'amorce se fixe sur l'ARN (sert a stabiliser ARNm et facilite son transport et joue un role dans la traduction)
Epissage du transcrit primaire
Excision des introns
il est nécessaire..
Site donneur GU
Site accepteur AG
site de branchement (A)
un complexe epissage : SnRNa (petit arn) + proteine = snRNP
7 Possibilité d'épissage différent
la cellule peut décider qu'un exon peut être utile ou pas -> chaque gène peut donner différentes proteines par la présence d'un épissage alternatif
Territoire du noyau occupé par l'ARN poly A et la machinerie d'epissage
epissage ne se fait pas de facon homogène
anneau de Balbiani pour sortir du noyau par les pores et il est accompagné par
le CBC sur la coiffe
PABP au niveau de la queue et protège
hnRNP = pour le compactage
SR
EJC se fixe sur les jonction entre deux exons